นารูโตะที่ถูกจับตัวไปทั้งที่ไม่ได้มีความผิด ถูกส่งตัวไปที่ปราสาทโฮซุกิ สถานกักกันที่ไม่สามารถหลบหนีได้ พวกนักโทษปริศนาคืบคลานเข้าใกล้นารูโตะที่ถูกเจ้าของปราสาทชิงเอาพลังนินจาไป ริวเซสึ หน่วยรากแห่งคุสะคากุเระ และมาโรอิ นินจาที่เต็มไปด้วยลับลมคมใน....สุดท้ายแล้ว เป้าหมายของพวกเขาคืออะไรกันแน่